Hội Nghiên cứu Bệnh hại Thực vật Việt Nam (tên tiếng Anh: Vietnamese Phytopathological Society, tên viết tắt: VPS) được thành lập vào ngày 28/9/2001 trực thuộc Hội các ngành Sinh học Việt Nam với tên gọi ban đầu là Hội Sinh học Phân tử Bệnh lý Thực vật Việt Nam (2001-2008). Hội là tổ chức xã hội – nghề nghiệp của các tổ chức và công dân Việt Nam đã và đang hoạt động trong lĩnh vực nghiên cứu khoa học, giảng dạy, giáo dục và đào tạo, tư vấn, quản lý khoa học trong ngành Nông – Lâm nghiệp và các loại bệnh hại thực vật trong Nông – Lâm nghiệp trên phạm vi cả nước.

      Ngày 26/6/2019, theo Quyết định số 515/QĐ-BNV của Bộ trưởng Bộ Nội vụ, Hội trở thành đơn vị đầu tiên trong số 16 Hội trực thuộc Hội các ngành Sinh học Việt Nam được thành lập với tư cách pháp nhân độc lập. Ngày 03/8/2019, Đại hội Đại biểu toàn quốc lần thứ nhất nhiệm kỳ 2019-2024 tổ chức tại Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp Miền Nam đã thành công tốt đẹp và được Bộ Nội vụ công nhận. Đến ngày 07/5/2020, Hội đã được cấp con dấu riêng. Ngày 19/7/2024, Đại hội Đại biểu nhiệm kỳ 2024-2029 đã tiếp tục được tổ chức thành công tại Học viện Nông nghiệp Việt Nam.